Zavod za Zastopanje malih delničarjev sestavljajo sledeči organi: skupščina Zavoda ZIZMD; svet Zavoda ZIZMD; strokovni svet Zavoda ZIZMD; predsedstvo ZIZMD in direktor ZIZMD. Predsednik in pooblaščeni zastopnik Zavoda ZIZMD je Stanislav Zajšek.

Zavod ZIZMD ima naslednje članstvo: redne člane, pridružene člane, častne člane in razna društva s sorodnimi delovanji. Spomladi leta 2010 smo podpisali sporazum z Društvom malih delničarjev iz Ljubljane - SKUPAJ SMO MOČNEJŠI! Sicer pa Zavod ZIZMD dobro sodeluje z vsemi sorodnimi društvi in organizacijami doma in v tujini.